Observou que há bibliotecas do 12.04 sendo citadas na listagem? Com certeza o problema está relacionado com isso.
Aliás, essas bibliotecas estão localizadas em /opt, o que indica que são parte de um pacote externo instalado (o que também é uma pista de pq são do 12.04).
Eu desinstalaria essas bibliotecas e testaria novamente; talvez vc tenha que reinstalar novamente o Apache (ou, pelo menos, o sub-pacote original que contém esses arquivos) pra voltar ao normal. Mesmo que vc dependa dessas bibliotecas específicas, é importante ver o sistema em situação de normalidade. Depois vc entra em contato com os desenvolvedores, pra saber se há versão mais nova.