Informações da última versão: Ubuntu Linux 20.10 - Groovy Gorilla
Mais informações aqui: http://www.linuxfromscratch.org/blfs/view/svn/multimedia/transcode.htmlDependendo do que quer transcodificar, o pacote vlc faz isto para você e tem na central de programas do Ubuntu, tornando as coisas muito mais fáceis para você
Para unir avi leia istohttp://ubuntuforum-pt.org/index.php?topic=67626.0
Mas o transcode é apenas em linha de comandos mesmo. Ele não possui interface gráfica.