Existem algumas formas de listar tudo e instalar, mas sem alguns arquivos do /etc o apt-get não deve funcionar corretamente, por ex. a lista dos repositórios principais é /etc/apt/sources.list, e se precisar do sudo o arquivo que dita quem pode usá-lo é /etc/sudoers. Mas esse nem é o principal problema, provavelmente é até melhor fazer a recuperação a partir de um livecd apesar de a principio não ser impossível de fazer do próprio sistema, o que complica é que reinstalando tudo alguns arquivos devem ficar com configuração de fabrica, por ex. o /etc/fstab que é alterado/gerado durante a instalação do sistema ou os grupos e usuários criados por você, que não vão constar nos arquivos /etc/{group,gshadow,password,shadow}.