Eu conheço o Nagios, mas não gosto muito dele... o problema é que ele não tem uma interface de configuração, você tem que fazer suas configurações via console. E até onde eu pude ver, o projeto do Nagios andava meio parado.
Bem, como estamos falando de uma implantação para uma empresa, acho que posso indicar uma solução comercial, mas que é baseada em Nagios, mas contém sim uma interface de configuração gráfica, assim módulos de Dashboards e Relatórios muito bons.
O nome da solução que estou falando é OpMon, eu trabalhei no suporte e desenvolvimento de plugins/addons para esta ferramenta na empresa que a desenvolve, eu acho uma ótima solução.
Para que quiser ter mais informações sobre ela, segue o link do site da empresa que a desenvolve:
http://www.opservices.com.br/pt-brOu se quiserem podem me contatar pelo Skype: raul.liota