Marc, deixa eu te dizer uma coisa.
Fiz faculdade de Música na UFRGS, e lá todos costumam usar o Encore como editor de partituras - e quem trabalha com música eletroacústica usa Nuendo ou Pro Tools. Eu usei o MuseScore e o Ardour - e nem por isso deixei de fazer o curso ou fui reprovado em alguma disciplina.
Ou seja: não importa a ferramenta usada, o que vale é o resultado final.