Não é possível emular, porque não há emulador de windows para Linux. Agora se vc quiser rodar o AutoCad, por meio da famosa
camada de compatibilidade Wine, isso sim é possível. Mas recomendo usar o PlayOnLinux, ele é um programa que te ajuda instalar programas do windows no Ubuntu, ele procura a versão do Wine mais compativel com seu programa, baixa o wine, e instala tanto o wine como o AutoCad.
Existe um software equivalente ao AutoCad, chamado DraftSight, já ouviu falar? Ele trabalha com os mesmos arquivos do AutoCad (.dwg), e já ouvi muita gente falando bem dele. E o melhor: existe nativo para Ubuntu!
http://www.3ds.com/products/draftsight/download-draftsight/