Consegui resolver meu problema, antes eu estava usando a partição como ext2, reinstalei formatando para ext4 e os problemas foram resolvidos. Outro detalhe foi remover o pendrive antes de iniciar o sistema após instalação. Tentei de tudo que vi em tutoriais nada resolvia, agora ta 100% aqui. Reconhecendo e montando todas minhas partições e pendrives.