rodrigo666,
sudo gedit /etc/X11/xorg.conf
Procura por "AGP", basta retirar essa opção.
Eu tenho uma Radeon 9600 Pro, a minha configuração do driver é:
Section "Device"
Identifier "ATI Technologies, Inc. Radeon R300 NE [Radeon 9500 Pro]"
Driver "fglrx"
BusID "PCI:2:0:0"
EndSection