Resolvi o meu problema removendo alguns pacotes:
sudo apt-get remove appmenu-gtk3 appmenu-gtk appmenu-qt
Talvez isso não faça sentido, mas pra quem quer usar apenas um painel na parte inferior no modo Fallback isso deixa o desktop mais "limpo" e não altera nada no Unity.
(Obs.: Esse comando desabilita o menu global do Unity o qual fica no painel superior, para retornar é só reinstalar os pacotes.)
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