Resolvi meu problema com os dois monitores!!!
bastando digitar os seguintes códigos:
*** Antes de digitar qualquer código, criei uma cópia de segurança do arquivo xorg.conf só para ter como restaurar se algo der errado:
sudo cp /etc/X11/xorg.conf /etc/X11/xorg.conf_bkp
//criando arquivo de backup do xorg.conf
feito isso, apaguei o xorg.conf em /etc/X11/, retirei o cabo do monitor externo e reiniciei o computador. Quando o mesmo iniciou normalmente (pois nao precisa das informações do xorg.conf para iniciar) digitei os seguintes comandos:
sudo aticonfig --initial --output=/etc/X11/xorg.conf
// Esse código faz com que o driver da ATI fique configurado por padrão e salva suas configurações padrões no xorg.conf (por curiosidade, vale a pena ver o que o aticonfig escreveu no xorg.conf, e guardar um backup desse arquivo como o primeiro.
Feito isso, reinicie o computador e o mesmo iniciará com as configs básicas da ATI. A partir de agora, qualquer alteração que fizeres no ATI Catalyst Control Center afetará e mudará automaticamente o xorg.conf; Então é só mexer no ATI CCC que o mesmo dá conta de gerenciar toda parte gráfica do pc. Porém, para funcionar os dois monitores do jeito que eu quero (duas áreas de trabalhos distintas, em monitores diferentes e com resoluções e taxas de atualização diferentes) só executar esse comando:
sudo aticonfig --initial --lcd --lcd-mode=full --dtop --desktop-setup=clone --enable-monitor=lvds,crt1
//Com isso, ele vai dar uns erros que os comandos enable-monitor nao pode ser feito por causa do xrandr em execução, mas de boa! Agora reinicie seu computador e faça as configurações que desejar no ATI CCC. Pois o mesmo funcionará corretamente
P.S.: Antes de fazer essas modificações meu ATI CCC causava alguns travamentos por alterar umas configurações, porém agora tá novo... 100%! Sem travamentos, sem dor de cabeça, resoluções e taxas de atualizações diferentes em monitores diferentes (4:3) e (16:9) fino demais!!
Espero que isso ajude várias pessoas com o mesmo problema!