Sei que o tópico é antigo, mas talvez ainda sirva para alguem (como eu), estava com o mesmo problema, em Aplicativos -> Multimidia ... só tem um icone do audacious, e ao abrir o mesmo ele iniciava com uma interface bem simples e no menu preferences não tinha a opção skins, fucei até consiguir abilitar as opções de skins assim:
Inicie o Audacious normalmente
clique em View -> Interface -> Winanp classic interface
Pronto, agora seu audacious vai habilitar o menu skins pra vc alterar em preferences.
Só uma coisa que eu ainda não consigui arrumar, ele não consegue guardar as configurações que eu escolhi como skin e pluguins, toda vez que inicio ele ele abre com a skin default e sem nenhum plugin.
Abraços a todos.
Edit: Ae galera consigui fazer o audacious gravar as opções que eu escolhi, eu abri ele como sudo no terminal, então selecionei a skin e os plugins que eu queria, fechei normalmente e ao abrir ele clicando em Aplicativos -> Multimidia -> Audacious, ele abriu com eu queria!
Abraços a todos.