Irtigor
Me desculpe pela demora na resposta, pois estava muito doente, hospital, etc..e só recentemente sarei.
Mas voltando ao assunto, é quase em todos os programas, e acho que tudo está configurado corretamente. Bom, não sou tão iniciante mais assim no Linux, embora serei um eterno aprendiz.
Aqui uma lista incompleta rsrs; Baobab, Devede, K9copy, Nero-Linux, OpenShot, QDVDAuthor, NVIDIA X Server Settings, Utilitário de Unidades.
Os que não são graves, a altura da janela fica um pouco maior, e nesse caso o que me salva são os botões de ocultação, tanto no painel inferior quanto no superior que eu ativei.
Isso é a única coisa que não consegui resolver no Ubuntu, de algumas que apareceram desde que migrei de SO.