Olá,
bem... instalar programas no linux é bem diferente do windows.
na maioria das vezes, os programas que você quer já estão nos repositórios oficiais, e aí você pode baixá-los com o Synaptic( Sistemas -> Administração)
qualquer coisa, dê-nos mais detalhes sobre os programas que quer instalar e tentaremos ajudar.
Quanto às pastas do windows, o Ubuntu monta automaticamente...,
mas aí... temos que analisar o seu arquivo(/etc/fstab)
valeu!