olá, também estou com a mesma dúvida. Eu uso a Barra de Menu Personalizada (menu-bar) no painel superior, e o Menu Principal (menu-object) no painel inferior. Uso um tema silver que pra mim cansa menos a visão, mas a cor dos ícones logo do ubuntu não ficaram muito legais. Consegui mudar o ícone do Menu Principal, mas o da Barra de Menu eu não consigo. Tentei da seguinte forma:
Editor de configurações -> apps -> panel -> objects.
Seleccionei use_custon_icom e depois adicionei a localização da imagem em custon_icon.
Deu certo no menu principal, mas na barra de menu personalizada não. Normalmente, no meu caso, encontrei-os em object_0 e object_3 respectivamente.
Se alguém souber como resolver agradeço.