Olá Gian.
Já tive esse problema sim.
Primeiro, tente o seguinte: vá no Synaptic e desinstale tudo o que tiver instalado de flash.
Depois, vá no site da adobe, baixe o plugin do flash manualmente e instale ele.
No meu caso, isso resolveu, eu também tava tendo problemas apenas com alguns sites (o globoesporte era um deles...rsr)
Tenta aí, qquer coisa vc posta de novo aqui no forum.
flw