seu usuário não tem permissão, esse é o problema.
tem varias formas de fazer isso, pelo terminal com o comando cp (copiar).
sudo cp /media/PENDRIVE/arquivo /var/cache/apt/archives
pode destravar a pasta pelo terminal liberando as permissões com o chmod e copiar pelo modo grafico, veja como seria o comando:
sudo chmod 777 /var/cache/apt/archives
agora pode abrir a pasta pelo modo grafico e gravar os dados, lembrando que a permissão atual da pasta archives é 755, acho.
pode abrir o nautilus como administrador e copiar pelo modo grafico dando o comando no terminal:
sudo nautilus
O meio mais pratico:
Pode dar o seguinte comando no terminal:
sudo apt-get install nautilus-actions nautilus-gksu
em seguida pressionar alt + f2 e digitar killall nautilus, agora, va até a pasta archives, clique com o botão direito e selecione "Abrir como administrador".
Sempre que não tiver acesso a gravação a uma pasta, basta clicar na mesma com o botão direito e selecionar essa opção.