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pesquisando na net descobri o seguinte: essa versao que aparece após compilar na verdade é uma variavel que fica nas primeiras linhas do arquivo Makefile do linux-source-2.6.28.x q vc baixou...no meu caso estou com a 2.6.28.12 e quando compilei apareceu o bendito 9, porem quando eu olhava o kernel-version do source aparecia 12.resumindo, pelo que eu entendi o povo do ubuntu esqueceu de alterar esse numero no Makefile do linux-source Sem Graça ai vc altera lá e vai aparecer bunitinho como voce quer... Apenas o numero que está aparecendo é o errado, voce esta realmente usando a versao do seu source que é provavelmente o 12 que foi o maior que achei no synaptic.