È uma marmota mesmo cara. mas faz o seguinte:
vai em sistema > preferencias > sessões
clica em adicionar
depois escreva na caixa com o nome "comando"
assim: cairo-dock -c
salva e pode reiniciar que vai iniciar bem legal
se voce esta com o compiz ativado não tem problema
se não vai ter que habilitar o "composite" para evitar uma tarja preta por baixo da dock
ai é so procurar aqui no forum que tem uma farta documentação sobre isso.
so não te dou logo a dica porque não estou lembrando.