A montagem dos Drivers Leitores de CD-ROM ou DVD são feitas automaticamente no Ubuntu. Desde de que você tenha configurado tudo corretamente na BIOS do seu PC.
Como está a montagem dos seus Drivers? Me refiro a montagem física. Quem está na IDE primária e quem está na secundária? Quem é o master e quem é o Slave? Você configurou a BIOS pra reconhecer eles como? Na auto ou manualmente?
Aqui ainda não passei por este problema no meu PC. Atualmente tenho um CD-ROM e uma gravadora de DVD. Os dois são corretamente montados pelo Ubuntu. Mas já tive um gravador de CD, que também era motando automaticamente.