Normalmente os equalizadores estão presentes no player, mas se no caso for para edição de som use o Audacity (excelente editor(presente no Synaptic)).
Além disso existem vários mixers no Ubuntu: Digite mixer no Synaptic.
Caso não sabe como:
Vai no Synaptic (Sistema -> Administração -> Gerenciador de Pacotes Synaptic) e lá vc clica em Procurar, e em "procurar em:" coloque "Descrição e Nome" e depois pesquise por mixer ou por outros tipos de programas que desejar! (em ingles a busca vai muito mais longe!)