gandaran,
você pode tentar trocar os drivers da sua placa gráfica ( onboard ou não) pelos últimos disponíveis, se já não o fez - tente pelo Gerenciador de Drivers Restritos, ou talvez pelo Envy; é possível que isso resolva os problemas da frequência de 85 Hz no boot ( aliás, nunca havia visto isso...).
Quanto a resolução x varredura, esse problema pode ser menos visível nos monitores LCD, mas faça o seguinte teste: abra uma tela totalmente branca ( pode ser um arquivo de texto vazio), depois olhe por um meio minuto não diretamente para o monitor, mas para um ponto uns 20 cm ao lado dele. Se notar que a tela branca parece "tremer", esse é o problema... chama-se "flicker", e significa que a imagem na tela está sendo atualizada numa frequência muito baixa, forçando seus olhos. Em monitores CRT, a frequência de varredura ( atualização) só pode ser de 60 Hz em resolução 800 x600 ou menor; em 1024 x 768, deve ser de pelo menos 75 Hz.
Você não disse se já segui a dica do fabiovalinhos; creio que ela pode resolver seu problema.
VB5