Tente primeiro verificar o desempenho do seus HDs com o comando:
$ sudo hdparm -Tt /dev/hdX
ou se for SATA,
$ sudo hdparm -Tt /dev/sdX
onde X é a letra referente ao seu HD, pode ser a, b, c, etc.
Para ter uma idéia para comparação, meu HD consegue uma taxa de 52 MiB/s. Rode o comando várias vezes, descarte o primeiro resultado e faça uma média dos restantes.