Vamos supor na maquina 1 tem os arquivos ja atualizados e instalados, a maquina 2 esta "crua", ambas com acesso via SSH!
vá na maquina 2 e execute:
# cd /var/apt/cache/archives
# scp [usuario]@[IP]:/var/cache/apt/archives/*.deb . (se quiser os "parciais" scp -r ....)
depois de tudo copiado, é só usar o apt-get ou Synaptic.
se tiver muitas maquinas pode deixar 1 como central, exportar via nfs o /var/cache/apt/archives/ para, por exemplo, /var/arquivos e depois fazer um ln para dentro do /var/cache/apt/archives/ assim você sempre terá um unico repositorio dos arquivos deb.