Pelo que intendi, você quer deixar o XP na partição "C:", e o Ubuntu na "D:". É isso? Bom, tanto faz em qual partição você vai instalar, os dois sistemas operacionais rodam juntos tranquilos. Na hora da inicialização, você escolhe qual quer usar. Na hora da instalação, vai ser "C:" = "hda1", e "D:" = "hda2".