Não não amigo. O Synaptic apenas instala os pacotes que estão nos repositórios.
Esse Kernel 3.9 não está nos repositórios oficiais do Ubuntu, ele ainda está meio instável e pode gerar problemas.
O Kernel 3.5 com certeza está muito mais estável e atualizado, mantenha uma versão antiga do Kernel, para assim, problemas futuros, você consiga resolver.
-------------------------
Como o Tota já explicou aqui no Fórum, esses posts do SempreUpdate, não são 100% confiáveis, porque não são 100% testados, e também não fica estável em todos os sistemas.