Camarada, não entendi bem o a parte do: "libre office não abre nenhum aplicativo quando eu clico ao invés de abrir o aplicativo abre o gerenciador de pacotes".
Se você estava se referindo aos arquivos (.odt, .doc, .docx, .ppt...) tente o seguinte:
1º Botão direito no arquivo
2º Propriedades> Aba "Abrir com"> escolha o libreoffice
Se não era isso, explique melhor o que está tentando fazer.