hraposo,
deverias ter o cuidado de ler com atenção o manual do programa antes de o utilizar, podias ter perdido o teu email.
FetchYahoo is a Perl script that downloads mail from a Yahoo! account to a local mail spool.
-> Isto significa que os emails ficam na maquina local no sistema de email do seu sistema linux, mais concretamente no email do teu utilizador. Para ler o email basta utilizar um qualquer cliente de email e configurar para leres a tua mailbox de sistema.
O mais lógico é a mensagem ter sido apagada do servidor depois de ter sido descarregada, certo ?