Depende muito da placa de vídeo. O compiz é um gerenciador de janelas com efeitos gráficos 3D, que funciona melhor numa placa com aceleração. Mas, isso depende muito do pacote de vídeo usado. O Nvidia disponibilizado pelo ubuntu, por exemplo, costuma ter um desempenho pior do que o oficial, que pode ser instalado via ppa.
O correto é você se informar sobre sua placa de vídeo (configurações do chipset, se for um notebook com vídeo integrado) e procurar usar o pacote do fabricante. Use o comando lshw e verifique no campo display qual é a especificação do fabricante da placa de vídeo.
Depois, procura no fórum, em dicas, um tutorial para esse fabricante (Nvidia ou ATI).