Desculpe, não está claro pra mim uma coisa: o problema acontece depois que você usa o Ubuntu nessa máquina (ou seja, você ainda usa o Ubuntu nessa máquina), ou passou a acontecer depois que você usou o Ubuntu nessa máquina (ou seja, você não usa mais o Ubuntu nessa máquina)?
Explico minha dúvida: seu problema não é no Ubuntu, mas sim no Windows, assim, não deveria ser resolvido neste fórum. Se você não usa mais o Ubuntu, não tem o que possamos fazer, no máximo indicar outro fórum pra ver a solução.
Mas se você ainda usa o Ubuntu, pode ser que o problema no Windows esteja sendo causado por alguma coisa que esteja sendo feita no Ubuntu. E só aí poderemos ajudar.