Ah, agora que eu entendi... vc quer instalar
o Ubuntu no HD externo, não um HD externo no Ubuntu...
[as preposições, nessa hora, ajudam...]
Olha, instalar é fácil: basta dar boot na máquina com o LiveCD e o HD externo plugado, e depois selecionar o HD externo na hora de particionar.
Difícil é fazer a máquina dar boot no HD externo. Nem todas conseguem, e não é por culpa do Ubuntu, e sim por causa do BIOS da máquina.
Se parar pra pensar, não tem diferença entre fazer isso e instalar o sistema em um pendrive. Talvez só o tamanho da unidade...