Rodrigo, de imediato realmente nao vai haver substituiçao, mas acho que a maior parte da polemica gerada é pelo o que esta por vir, o gnome painel nao vai estar disponivel como opçao pra sempre, isso é fato, considerando esse fato e o tambem fato de que nao havera mais qualquer contribuiçao da canonical para o codigo do gnome-shell e seus futuros descendentes, ha uma preocupaçao, nao com essa versao do ubuntu em especifico, mas do que sera do futuro da distribuiçao.
e isso nao se restringe apenas a questao do gnome-shell x unity, mas se entra na questao de red hat x canonical em relaçao a influencia no projeto gnome. a red hat tem precionado o gnome para seguir um certo caminho, e ela tem esse poder por ser o maior mantenedora da biblioteca gtk, ja a canonical tem certo poder tambem, ja que a sua distribuiçao responde pela esmagadora maioria de usuarios do sistema.
concordo que tem muita gente falando erradamente sobre a questao do unity, mas a discuçao em torno de dele tambem nao se resolve apenas com o esclarecimento de que ainda vai haver a opçao do gnome painel.