Lendo sobre o gnome shell encontrei:
Outra situação problemática é o caso de você estar a utilizar algum repositório que tenha uma versão alternativa do pacote Clutter. Caso tenha algum problema e tenha repositórios de terceiros instalados, considere este facto e veja pelo Gestor de Pacotes do Synaptic por onde instalou esse pacote, se pelos repositórios oficiais do Gnome-Shell, ou se por outro repositório de terceiros.