Olá amigo, sobre a questão de virus na maioria dos casos você não tem que se preucupar no Linux.
Um virus que você executar com o Wine, pode até fazer alguma coisa, mais eu não conheço nenhum caso de ter complemetido todo o sistema, isto porque para fazer certa ações e necessario estár como root.
Se você entrar em algum site, dificilmente vai pegar um virus.
Para escanear os arquivos do Windows no Linux para procurar pode usar o Clamav e gratuito e livre, no entanto lembro que ele e só pra verificar os arquivos do Windows, você até pode verificar arquivos do Linux com ele, mais não irá detectar nada porque é para arquivos do Windows.
Se sua duvida e se tem malware pra Linux minha resposta é: Tem mais e muito dificil ser infectado se seguir alguns cuidados, além disso a quantidade de malwares para Linux e muito pouca.
Pode usar um Firewall e programas como Rkhunter e chkrootkit.
