Ola,
O arquivo ./configure esta dentro da pasta onde descompactou o pacote binário
Dentro de 99% destes pacotes você encontra também um arquivo "readme" para ser lido antes de se utilizar o ./configure, pois pode ser necessário modificar algumas entradas de diretórios, que variam de distro para distro.
como parece que você é novato no sistema, começe instalando pacotes via gerenciador de pacotes synaptic.
Ou pelo menos poste aqui qual pacote está tentando instalar.
[],s