Sabe entrar na BIOS? Normalmente algo como "press F2 to run SETUP" , "press F9 to SETUP" , "DEL - SETUP"...
Depende da sua BIOS, já que não especificou sua placa mãe fica difícil colocar aqui o procedimento para todas as versões.
Entrando na BIOS poderia acompanhar a temperatura dos periféricos do computador durante estes primeiro minutos. Limitar a temperatura máxima que ele pode atingir e até escolher qual procedimento o computador adotará. Claro, dependendo da BIOS.
O procedimento adotado para a substituição do processador também não foi citado. Há tecnologias para travar, reiniciar, ou mesmo desligar o computador se ele ou componentes dele atingirem temperaturas definidas como perigosas. Pesquisou algo sobre isto?
Os fios que ligam um cooler podem, além de não girarem por estarem presos por algo, estarem conectados em lugar errado. O cooler do processador pode estar conectado no lugar do cooler lateral do gabinete, frontal, traseiro ou destinado a algum outro fim. Interpretando as informações erradas o computador pode tomar uma decisão errada.
Volte sempre. =)