Bom, quanto ao CAD ainda uso em Windows mesmo por que tem alguns recursos que necessito e no Linux não encontrei.
Pelo jeito você meche com eletrônica, então vai entender o que vou dizer, o Eagle é muito bom, tanto para Windows quanto Linux, agora simulador CLP já é um problema, não conheço nenhum, tenta rodar o Step7 pelo Wine que talvez da certo. Simulador pneumático também não conheço, roda o Fluidsim da Festo pelo Wine também. OBS: nunca rodei nenhum desses programas que citei (Fluidsim e Step7) pelo Wine, prefiro rodar pelo Win mesmo, ou tenta rodar dentro de uma máquina virtual.
Quanto a circuitos elétricos tem bons programas pra Linux sim, não me lembro o nome de nenhum agora
, eu costumo usar o LabVIEW da National Instrumens, e ele tem versão nativa para Linux, da mesma empresa tem o Multisim, mas não sei se tem versão para Linux, se roda pelo Wine ou só para Win mesmo.
É meio complicado mesmo, já que muitos desses softwares são pagos e só tem versões para Win, mas as vezes da para dar jeito. Um programa que na minha opinião deveria ter versões para Linux é o Proteus, mas para variar até hoje só rodo pelo Windows.