eu uso o avast versao linux para escanear o windows, muito bom tem uma interface grafica legal e pratica.
vc pode encontra-lo na home page do avast, se preferir tem por linha de comando tbm se eu nao estiver enganado e o clamav ,otimo antivirus.
lembrando que no linux nao precisa de antivirus ,e firewall instalei o firestarter muito pratico, mas sinceramente nao notei diferença quanto a segurança com ou sem o firestarter e nao uso mais.