Olá !
Está acontecendo comigo também e já há vários relatos.
Sugiro que não tente consertar, você poderá piorar a situação, aguarde actualizações que poderão corrigir este problema. Use uma das opções já existente no seu sistema em "Aparência" ou mude as cores a seu gosto.
Está acontecendo vários problemas com as decorações de janelas, principalmente os temas Human e Human clearlook, que são padrões no Ubuntu.
Exemplo: Passando o ponteiro do mouse nos botões minimizar ou fechar janelas a barra de títulos muda de estado ou pisca. Ao tentar instalar um novo tema, como ocorre o que você relatou, aparece uma mensagem dizendo que o tema não é suportado ou que tenha que instalar algum pacote.
Tenha paciência e aguarde correções.
Boa sorte.
