Bem até concordo com o que o Felix falou, e não uso aqui interface gáfica nos meus servers, porém, contudo, todavia, do que adianta montar um server sem ela (o que é o ideal) e depois não conseguir usar?
Assim acho que se você quer aprender, e testar muito e brincar um pouco instale a versão desktop, mas saiba que realmente esta usando recursos essenciais do sistema apenas para visualizar ícones e janelas.
Outro ponto de destaque é que instalar um servidor nem sempre é difícil, mesmo usando apenas interface caracter, visto que você pode apenas seguir bons tutoriais encontrados na internet, mas o problema sempre é depois de instalado, ou seja, manter ele funcionando de forma correta, e é ai que a coisa costuma apertar.
Então se você vai instalar um servidor "doméstico", digamos assim, ou de pequeno porte, sem muitas espectativas pode fazê-lo mesmo usando o Ubuntu Desktop, e ai vai aprender, claro que lendo um bocado, mas se você quer fazer isto para algo grande, ou que precise de alta performace e que funcione 24h/d x 7d/s x 365d/a aconselho a ler bem antes, se inteirar bem de tudo, e ai seguir os conselhos do Felix.
Para não dizer que fiquei só na conversa segue um link (em inglês) que poderá te ajudar:
Servers []'s e boa sorte!
Cristiano