Colega, acabei de receber um do trabalho e pesquisei muito antes de instalar o Ubuntu nele.
Ele tem sim uma MBR especial para funcionar o botão ThinkAdvantage.
O procedimento correto antes de instalar o Ubuntu é:
1) você tirar uma cópia da MBR
2) gerar os CDs de restauração do sistema pelo aplicativo do thinkpad
3) Instalar o Ubuntu pela interface TEXTO e não deixando ele colocar o GRUB na MBR master, e sim na MBR da partição do Ubuntu.
Feito isso deve estar tudo funcionando.
No meu thinkpad aqui eu fiz tudo direitinho, mas tive um problema na hora de gravar a MBR na partição, e comecei a testar em outras. O resultado é que o botão ThinkAdvantage funciona, mas na hora que ele vai bootar o Ruindows acho que o GRUB ficou instalado nessa partição e dá pau. Felizmente tenho os 7 CDs de recuperação de fábrica.
Tente fazer o seguinte, ê boot em um LiveCD ou qualquer outro sistema onde você possa editar as partições do seu HD. Coloque a partição FAT32 de recuperação que tem no HD escondida como bootável. Dê um boot e veja se ela boota normalmente. Isso deve restaurar o seu HD como veio de fábrica.
Se não der certo, posso passar a imagem que tenho aqui da minha MBR original, que com um comando você a restaura aí.
Um abraço.