1.ª questão
Coloque as placas de rede no ubuntu e manda ver, por que?
Se é iniciante e que mesmo levar adiante seu conhecimento, é bom meter a mão na massa no linux, utiliza-lo como s.o principal, se adaptar e aprender a trabalhar mais com ele, fazendo roteamento, nat, etc...
2.ª questão
Entre windows e linux, não existe diferença, pois só vai configurar a rede no linux como no windows. Entre linux e windows, dependendo da sua estrutura, existe diferença, ainda mais se procurar estabelecer algumas coisas como:
Acessar a maquina windows passando pelo linux de outra rede ou pela internet.
Compartilhamento da net do linux pro windows
etc...
E, principalmente, tera a oportunidade de mexer com o samba, transformar o linux em servidor de dominio, impressão...
Ai vc vai mexer bastante no linux.