Repasso o que encontrei, mas use por conta e risco - nunca testei!...
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sudo mkfs.vfat /dev/sda
procure pelo arquivo ".hal-mtab" na pasta /media (insira o pendrive antes) ou pelo arquivo "mtab" na pasta /etc, isso para descobrir o "dispositivo" associado ao seu pendrive ( o qe substitui o 'sda' acima).
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Boa sorte!...
VB5