Na verdade, o hardware é emulado via software quando se roda uma VM.
Isso quer dizer, ao menos no Vmware (que eu uso), que a minha placa Nvidia não é suportada pelas VMs onde tenho o Fedora e o Slackware instalados.
Não sei se isso vale para o Windows, mas acredito que a resposta seja positiva, ou seja, haverá limitação de uso do hardware emulado.