ArKanjo,
O nvidia-glx é o da versão 9639 que, posso afirmar com segurança, dá suporte à sua controladora, pois até recentemente, quando fiz um upgrade do meu equipamento, eu tinha uma mx-4000 e três distros instaladas com esse driver.
Atualmente, eu tenho uma onboard 6100, e ao instalar o nvidia-glx-new, ocorreu o mesmo problema que você relatou. O que resolveu, após pesquisar por aí, foi o comando dpkg-reconfigure -phigh xserver-xorg.
Sugiro que você o tente.