Shadow:
o jeito mais fácil de trocar o logo do Ubuntu é este:
1. escolha o ícone que vc. quer usar (maçã, pé etc.), no formato png e com o tamanho 48x48, e renomeie o respectivo arquivo para "distributor-logo.png";
2. agora copie o arquivo renomeado para a pasta "/home/.icons/"seu_tema"/48x48/apps".
Para testar, baixe um tema novo (o meu é o OSX) e instale (basta arrastar o arquivo do tema para o gerenciador de temas - opção "Tema" em "Sistema -> Preferências"), seguindo depois os passos acima.
Abraço.