Depende quais os programas que estas a iniciar quando arranca o ubuntu.
O beryl tem de ser dos primeiros a iniciar vai a:
Sistema -> preferencias -> sessões -> Sessão Actual: e escolhes a prioridade do beryl tem de entrar antes que o skype e que o gaim, se não for antes é depois agr não me lembro muito bem, mas tenta jogar com as prioridades, pois a mim dava me isso, eu tinha k desligar o skype arrancar o beryl e so depois o skype...
Mas tenta fazer essas experiencias de qualquer forma se puderes deixar aki quais os programas que partem no arranque e as suas prioridades ja dava uma grande ajuda.
abraço
Tommy