Não consegui entender muito bem a questão, /Zeraszel /, talvez seja adequada você exemplificar usando o comando 'dir' do Windows comparativamnte ao 'ls' (ele + esse) para um mesmo diretório/pasta de exemplo, assim eventualmente fica mais clara a situação que você está tentando expor.
O Windows usa um sistema de arquivos ocultos (atributo -h) que não é considerado pelo Linux, são coisas diferentes, tratadas de forma diferente conforme a arquitetura específica de cada sistema operacional.