eu tava com um problema parecido....
da uma verificada nesse site (se é q voce ja nao olhou)
http://packages.ubuntu.com/dapper/x11/nvidia-glxnele fala tudo o que precisa, e mais algumas coisas q eles recomendam pra Nvidia no ubuntu...
o meu xorg.conf eu mexi o seguinte....
Section "Device"
Identifier "NVidia"
Driver "nvidia"
# Tenta usar qualquer uma das AGPs
#(0=Desabilita, 1=Suporte Interno, 2=AGPGART, 3=Auto)
Option "NvAGP" "3"
# Faz com que suma aquele logo ridiculo da nVidia da tela de inicia�o do X
Option "NoLogo" "off"
# Habilita/Desabilita Acelera�o de Renderiza�o
Option "RenderAccel" "on"
# Deixa as cores mais vivas (varia de 0 a 255)
Option "DigitalVibrance" "5"
# Habilita/Desabilita sombra do ponteiro do mouse
Option "CursorShadow" "on"
# Ajuste de contraste da sombra do mouse (varia de 0 a 255)
Option "CursorShadowAlpha" "64"
# Ajuste da sombra do mouse no eixo X (varia de 0 a 32)
Option "CursorShadowXOffset" "2"
# Ajuste da sombra do mouse no eixo Y (varia de 0 a 32)
Option "CursorShadowYOffset" "2"
# Define o tipo de monitor usado (CRT, DFP, TV)
Option "ConnectedMonitor" "CRT"
# Usa o HorizSync e o VertRefresh do EDID (Extended Display Identification Data)
#Option "UseEdidFreqs" "on"
# Ignora o uso de EDID
#Option "IgnoreEDID" "off"
#Opcoes para usar 2 monitores na mesma placa
#Option "TwinView"
#Option "SecondMonitorHorizSync" "30-50"
#Option "SecondMonitorVertRefresh" "60"
#Option "TwinViewOrientation" "RightOf"
#Option "MetaModes" "1024x768,1024x768"
#Option "ConnectedMonitor" "CRT, TV"
#Option "TVStandard" "PAL-M"
#Option "TVOutFormat" "COMPOSE"
EndSection
Section "Screen"
Identifier "Screen 1"
Device "NVidia"
Monitor "Philips 103E21"
DefaultDepth 32
Subsection "Display"
Depth 8
Modes "1024x768" "800x600" "640x480"
EndSubsection
Subsection "Display"
Depth 16
Modes "1024x768" "800x600" "640x480"
EndSubsection
Subsection "Display"
Depth 24
Modes "1024x768" "800x600" "640x480"
EndSubsection
Subsection "Display"
Depth 32
Modes "1024x768" "800x600" "640x480"
EndSubsection
EndSection
Section "ServerLayout"
Identifier "Simple Layout"
Screen "Screen 1"
InputDevice "Mouse1" "CorePointer"
InputDevice "Keyboard1" "CoreKeyboard"
EndSection
tenta dar uma olhada nas opcoes, ver se alguma pode te ajudar.