Eu acredito que a aplicação não tenha conseguido conectar-se ao banco porque o Firebird pelo Wine não funciona muito bem. Pode até rodar, mas fazer uma aplicação conseguir se conectar a ele é complicado.
No entanto, Firebird tem pra linux nativo, e inclusive dá pra instalar pelos repositórios do Ubuntu. Dessa maneira, é possível instalar o Firebird no Ubuntu, carregar nele o banco de dados da sua aplicação, e editar o clipp.ini do seu programa de modo a fazê-lo apontar para o endereço e porta da sua máquina local. Em teoria, isso é possível, e na prática funciona. O problema é que dá uma trabalheira danada hehe.
Alguns anos atrás, consegui fazer o Fortes AC funcionar seguindo essa mesma linha de raciocínio. O programa salva suas configurações em uma base de dados em Firebird, e toda vez que você instalava o programa, ele instalava junto um SGBD de Firebird, apontava a aplicação para esse SGBD, criava um banco de dados no SGBD e ficava salvando suas configurações nele. Tive que realizar vários passos em um PC com Windows (como a parte da criação do banco), mas no fim das contas funcionou.
Aqui há um tutorial ensinando como instalar e configurar o Firebird 2.5 no Ubuntu:
http://www.firebirdsql.org/manual/ubusetup.htmlVale ressaltar que a maioria dessas aplicações que usam Firebird são otimizadas para a versão 1.5, que por sua vez já é altamente defasada. No entanto, acredito que a aplicação funcione normalmente na 2.5, visto que o Fortes não apresentou problemas relacionados a banco de dados nessa versão. Caso precise especificamente da versão 1.5 do Firebird, possivelmente você precisará compilar do código-fonte, ou obter binários funcionais desta versão do Firebird.