Eu cheguei a desinstalar o Mate. O pessoal do Linux Mint configura um monte de coisa na mão, sei lá, pq é dificil deixar igual o ubuntu igual ao desktop deles.
Pois é... Comecei a ter problemas e mais problemas - muitos sem explicação - com qualquer interface baseada em GNOME 3.x (incluindo-se aí Unity 2D e 3D, GNOME Shell, GNOME Classic e Cinnamon), o que me fez mudar pro Linux Mint 13 MATE "de vez" (pus entre aspas porque, se tudo o que foi prometido quanto a correções de bugs e personalização no GNOME 3.8 realmente for cumprido, pode ser que eu tente o Ubuntu GNOME Remix 13.04).
Sobre se a equipe do Linux Mint faz configurações na mão ou sei lá o quê, não sei, só sei que nesse SO me parece que a interface MATE fica mais bonita. Hoje mesmo tentei uma instalação do Ubuntu Minimal 12.04 com os repositórios do MATE, instalei a interface e tudo o mais, mas ficou meio "sem graça"... A instalação não durou mais que uns 15 minutos e já pus o Mint 13 MATE de novo, e por hora vou deixar assim mesmo.